Tarō Komori tenta encontrar a conexão entre seus sonhos e o evento traumático envolvendo ele e sua irmã mais velha, Mizuka Komori, onze anos atrás. Ele recebe um novo terapeuta e o estudante de transferência Masayuki Nakajima começa a se aproximar dele e de Makoto Ōgami.

Masayuki revela a linha do tempo do incidente do seqüestro e teoriza que há uma conexão entre o caso e a morte do pai de Makoto. Tarō começa E.M.D.R. terapia, que reúne memórias previamente escondidas.

Masayuki convida Tarō e Makoto para viajarem para o antigo hospital, onde Tarō e Mizuka estavam escondidos quando foram sequestrados. A jornada revela muitas coisas sobre o passado dos três garotos.

Os três meninos continuam a explorar o hospital, e mais história sobre Masayuki e Makoto é revelada. Eventualmente, os três descobrem que há algo muito pouco natural no hospital.

Os três aprendem mais sobre projeção astral e o reino oculto de Makoto, devido ao seu conhecimento do grupo religioso que sua família possui. Os pais de Tarō, Ryoya e Miki Komori, conversam com Atsushi Hirata, seu psicólogo, e os três garotos mais tarde se encontram no reino oculto novamente.

Makoto olha através da mesa de seu pai e se lembra do passado, e Masayuki tenta sua própria versão de exposição à fobia. Depois de conhecer o velho viajante Genma Saruta em seu O.B.E, Tarō tenta encontrá-lo no dia seguinte, e sofre um súbito ataque narcoléptico em seu caminho de volta.

Tarō está no hospital depois de bater a cabeça nos degraus perto do santuário. Ele é visitado por Masayuki e os dois recebem uma extensa sessão de informações sobre o cérebro de Hirata e Reika Ōtori. Makoto confronta Motoi Yazaki sobre seus pais.

Hirata discute as possíveis razões para a perda de memória de Tarō. Tarō encontra o fantasma de um animal extinto e entra em uma fenda dimensional. Hirata passa por uma experiência sobrenatural.

Quatro adolescentes são atacados por um fantasma humanoide negro perto do antigo prédio abandonado onde o sequestrador foi atropelado e morto. Mais tarde, os três protagonistas investigam a área em seu estado de O.B.E., e o espírito se volta para eles.

Masayuki ajuda Michio Hoshino que é intimidado. Tarō e Masayuki começam a fazer perguntas sobre a montanha. Enquanto isso, Makoto descobre que ele pode se transformar em seu estado de O.B.E. O sacerdote xintoísta Takahito Komagusu encontra Saruta, que sugere que há outras duas pessoas além dele na montanha.

Um corpo foi encontrado flutuando na represa. A chamada maldição foi criada e os três protagonistas aprendem sobre a história dos quatro primeiros colegiais que foram ao hospital abandonado.

Takahito é chamado para a escola de Miyako Komagusu. Mais tarde, ele conhece e começa a consultar Hirata sobre Miyako. Hirata está começando a suspeitar que a área tem algo a ver com as ocorrências sobrenaturais. Enquanto isso Tarō vê Miyako sendo possuído em primeira mão.

Tarō teve um longo O.B.E. sequência onde ele vê Miyako na cama com febre e encontra Masato Kaibara como o Snark no reino oculto. Quando ele menciona o que Miyako disse em seu estado de possessão, Takahito fica com medo e diz para eles irem embora. Na parte inferior dos degraus do santuário está Noriko Kabata, a serva de Himeko Ōgami, avó de Makoto.

Takahito leva Miyako a Hirata para terapia, e Miyako depois entra em seu estado possesso. No caminho de volta ao santuário, Tarō, Masayuki, Makoto, Michio, Miyako e Takahito se encontram com Kabata. Ela pega Miyako e diz que Miyako é a próxima miko. Miyako então entra em transe novamente, e Makoto amaldiçoa furiosamente Himeko. Ele corre de volta para sua casa e encontra Himeko morto.

Makoto e Tarō vão para Kurata por várias razões. Eles visitam a casa de Kei Yakushi, e Tarō pede desculpas a Kei por estragar o processo da fermentação de levedura. Ele foi enviado para investigar a instalação de pesquisa de biotecnologia para vazamentos da indústria. Enquanto ouve os sonhos gravados de Tarō, Hirata passa pela experiência de Tarō no hospital.

Em Kurata, Tarō e Makoto encontram Sanae Ōgami, a mãe de Makoto, e Makoto faz uma tentativa fracassada de matá-la. Tarō reconhece o amante de Sanae, Masato, como o Snark. Ele vê seu pai falando com Reika sobre sua pesquisa, mas de repente ele é atacado por alguns monstros espíritos, conhecidos como monstros esperançosos, pelo assistente de laboratório de biotecnologia de Reika.

Saruta percebe que os espíritos estão com medo de alguma coisa. Ele avisa Takahito que há pessoas fora dos poderes de Miyako. Tarō diz a Miyako que ele acha que ela é a reencarnação de Mizuka, o que realmente perturba Miyako. Makoto ainda não retornou. Suzuki percebe que há um grupo suspeito de homens ao redor da casa dos Ōgami.

Suzuki fala com seu superior sobre as ligações com o grupo religioso Ōgami, seqüestros de crianças e doações de órgãos ilegais com o centro de pesquisa em biotecnologia. Miyako encontra Kabata, e Takahito foi encontrado sangrando nos degraus do santuário. A verdade sobre a morte do pai de Makoto e o seqüestro de Tarō vem à tona.

Makoto resgata Sanae de um incêndio na casa, mas Masato morre no processo. Ela acabara de acordar de um coma, mas sua memória regrediu. Takahito está em uma UTI, mas Miyako não reconhece Masayuki e Tarō. Kei relembra sobre Masato e como ela o amava de longe. Makoto se reconcilia com a mãe.

O grupo religioso Ōgami pode cuidar de Miyako. A pesquisa biotecnológica foi publicada à frente em outros países antes da pesquisa de Yasuhiro Nakajima, pai de Masayuki. Makoto fala com Suzuki e encontra ligações com o grupo religioso Ōgami com um grupo clandestino. O assistente de Reika libera mutantes, usados na pesquisa de Yasuhiro, na represa.

Makoto está hospedado na casa de Tarō e Ryōya dá a Makoto a guitarra que foi originalmente de propriedade do pai de Makoto. Takahito acorda, mas ele foi ameaçado. Hirata e Reika se encontram com Tarō, Masayuki, Makoto, Michio, Suzuki e Saruta no santuário. Tarō promete salvar Miyako.

Makoto e Masayuki ajudam a elaborar um plano para permitir que Tarō entre no santuário onde Miyako está sendo mantido como líder do grupo religioso Ōgami. Apenas mulheres e meninas podem entrar, então os garotos planejam vestir Tarō como uma jovem mulher para que ele possa entrar e resgatar Miyako. Hirata e Reika também ajudam na execução do plano.