Um estudante do colegial acorda numa escola e acaba descobrindo que está morto. Yuri, a primeira pessoa que viu ao despertar, explica que estavam no mundo pós morte e que precisavam lutar para se manter ali, mas o inimigo parecia inofensivo.

Ao constatarem que estão ficando com pouca munição, o grupo resolve ir até a guilda para reabastecer o estoque. Contudo, as armadilhas anti-anjo estão ativadas e eles precisam sobreviver pra chegar até lá.

Com a ajuda de um hacker, Yuri decide se infiltrar no esconderijo do Anjo. Para distrai-la, eles usam a banda Gldemo como distração.

Com o sumiço da vocalista de Gldemo, eles precisam substitui-la e Yui se candidata para tal. Enquanto isso, está acontecendo o Campeonato Esportivo na escola e Hinata tenta se redimir por um erro do passado.

Para diminuir os poderes do Anjo dentro da escola, o plano de Yuri é substituir as provas com respostas idiotas e assim afastá-la do conselho estudantil.

Como presidente substituto, Naoi, fica no lugar do Anjo e começa a sua operação para dar um jeito nos trangressores das regras escolares.

Com a entrada de Naoi para a Frente de Batalha, Yuri resolve pedir para que ele use seus poderes de hipnose para que Otonashi recorde do seu passado.

Depois da amizade entre Otonashi e o Anjo, clones poderosos de Kanade surgem e começam a atacar todos agressivamente. Eles precisam agir rápido contra este novo e poderoso mal.

Para lidar com os clones, o grupo resolve pedir mais uma vez a ajuda de seu companheiro hacker, enquanto Otonashi tenta lembrar de seu passado.

Depois de algumas resoluções, Otonashi resolve ajudar o Anjo a "apagar" as almas que estão presas ali naquela escola. A primeira pessoa que ele escolhe pra colocar seu plano em ação é Yui.

Enquanto Hinata e Naoi conversam, algo estranho acontece: sua sombra toma uma forma maior e ofensiva e tenta devorá-lo. E então é constatado que existe uma nova ameaça para eles que está em multiplicação constante.

Enquanto os membros da Frente de Batalha tentam combater os monstros em forma de sombra, Yuri arrisca-se em descer até a guilda em busca da causa do surgimento deste novo inimigo.

Quando Yuri acorda, ela se vê na enfermaria do colégio cercada por Kanade, Hinata, Naoi e Otonashi. Aparentemente estava tudo resolvido, eles só precisavam fazer uma última coisa que era o desejo de Kanade.