Kizuna é intimado por sua irmã para voltar a Ataraxia, uma cidade que não o traz boas memórias. Ao chegar lá, ele é surpreendido por inimigos atacando a cidade e uma garota se despindo em sua frente.

Kizuna é nomeado capitão do esquadrão de defesa da megailha: o Amaterasu. Em sua primeira missão, ele é mandado para uma ilha deserta para fazer uma busca por recursos. Só que o que era para ser uma missão segura rapidamente se torna perigosa devido à aparição de um Armamento Mágico.

Kizuna começa o seu dia sendo atacado pelas integrantes do Amaterasu e tem um encontro com Yurishia. Depois disso, ele descobre a realidade sobre Heart Hybrid Gear.

Chidorigafuchi e Kizuna estão incapacitados depois de uma batalha. A garota revela a Kizuna sobre o seu passado e pede à ele auxílio para invocar sua Arma Imoral.

Uma grande frota inimiga está bombardeando Atraxia, liderada por um navio de batalha com um grande canhão. Amaterasu dá seu melhor para derrotá-los, mas a Hybrid Count de Aine está muito baixa.

Himekawa precisa de mais poder para enfrentar o dragão de três cabeças que lhe causou tanto drama no passado. Mas o prazer do Climax Hybrid vai de contra à vida regrada que ela se cometeu a viver depois de falhar em proteger as pessoas embarcando para a Megailha de Tóquio. Cabe a Kizuna livrá-la dos traumas do passado e mostrar a ela como apreciar o êxtase que ela precisa para derrotar o inimigo.

Ataraxia se reúne com os Masters, os ases da Megailha EUA Oeste. Apesar de Yurishia ser a antiga líder deles, eles são muito frios com ela. A líder dos Masters, Scarlet, briga com Yurishia por conta de Kizuna, mas essa briga é interrompida quando outra guerreira de Batlantis aparece.

Depois da derrota para Grabel, o Amaterasu precisa de uma nova arma para proteger Ataraxia: o Connective Hybrid. Para usá-lo, Kizuna precisa realizar climax hybrid com duas garotas ao mesmo tempo. Ele decide usar Yurishia e Scarlet, visando diminuir a tensão entre elas.

A véspera para a operação para retomar Tóquio coincide com o festival escolar e ninguém consegue encontrar a Aine. O Amaterasu iria dar um grande show no fechamento do evento, então Kizuna sai em busca dela.

Kizuna finalmente se encontra com sua mãe, que se revela ser quem enviou os dados sobre o Eros para Ataraxia. Sua mãe está trabalhando com o Império de Batlantis e é agora uma inimiga da humanidade. Ela diz para eles irem até Tóquio, onde ela revelará mais de seus planos.

Começa a investida em Tóquio e o Amaterasu se vê em desvantagem contra os guardas reais de Batlantis. Cabe a Sylvia salvar o pessoal com seu Hybrid Heart. Quando a general inimiga usa o seu ataque especial para criar um buraco negro capaz de destruir Tóquio, ela precisa utilizar sua Arma Imoral para salvar a cidade.

Kizuna recria uma sala de aula cheia para tentar excitar Aine e fazer Hybrid Heart. Sua tentativa falha e, ao sair para fora da Love Room, eles veem que o resto do Amaterasu está sobre o controle de Zelshione. Kizuna tenta derrotá-la, mas não possui poder o suficiente para isso. Depois de dominar Aine, Zelshione a manda atacar Kizuna, mas algo inesperado acontece.