Baku Yorozu, um mestre dos sonhos lúcidos, salva a celebridade Nem, e atua no mundo onírico como um agente imbatível. Atacado por um monstro chamado Nightmare, Baku se vê encurralado, até que um indivíduo misterioso lhe entrega o Zeztz Driver e os Capsem, permitindo que ele se transforme em Kamen Rider Zeztz.

Baku sonha que está sendo perseguido pela polícia, acusado de causar explosões. Ele enfrenta o Nightmare responsável como Kamen Rider Zeztz, mas acorda ao ser derrotado. No mundo real, ele é questionado pelo detetive Fujimi e por sua parceira, Nasuka, da Divisão de Mistérios.

Depois de descobrir quem é o sonhador por trás do Nightmare bombardeiro, Baku corre contra o tempo tentando impedir que o pesadelo se realize, para salvar a vida dele. Enquanto isso, a Secretaria de Segurança Pública resolve dissolver a Divisão de Mistérios.

A nova missão de Baku é proteger Miyuki, filha de um Ministro, durante seu casamento. Quando o ensaio da cerimônia é atacado, Baku acredita que descobriu o sonhador e, apesar de duvidar de sua capacidade como agente no mundo real, segue investigando o suspeito.

Por que a noiva Miyuki é uma sonhadora? No mundo real, Baku continua a coletar informações e entra em contato com Miyuki, que está em pé diante de uma grande árvore no parque. Ele descobre que Miyuki carrega memórias capazes de mudar sua vida. No mundo dos sonhos, Baku encontra a “porta do coração” de Miyuki e, além dela, testemunha uma paisagem inesperada. Então, o pesadelo do corvo aparece novamente e ataca Miyuki e seus companheiros!

Em sua nova missão, Baku deve fugir de uma prisão com Nem e um casal que diz serem seus pais. No entanto, essa família parece guardar alguns segredos, e nem tudo é o que parece. Ao acordar, Baku conta com a ajuda de Minami para continuar sua investigação.

Fujimi e Nasuka compartilham as informações que receberam de Reiko. Relutante em acreditar no que ouviu, Baku resolve confrontar o presidente Bijogi, e descobre toda a verdade sobre Nem, e sobre o pesadelo que estão enfrentando. Com o pesadelo prestes a se realizar, os prisioneiros têm que achar uma forma de escapar da prisão do Nightmare.

Baku se infiltra na cozinha de um restaurante para cumprir sua próxima missão: impedir uma arma biológica de estragar um encontro entre autoridades do Japão e da república da Eldovia, e causar uma guerra entre os países. Enquanto ele tenta encontrar e destruir o Nightmare, Fujimi tenta mudar o cardápido do encontro, para evitar um desastre.

Depois de se recuperar do ataque do Nightmare, graças à ajuda de Nem e ao poder da Recovery Capsem, Baku é informado de que Sannoh nunca teve a intenção de servir a refeição do encontro entre os chefes de estado. Será que ele vai conseguir descobrir a localização da última Porta da Alma a tempo de salvar o sonhador e impedir a guerra?

Ainda abalado pelo roubo da Recovery Capsem, Baku tem uma nova missão: recuperar quadros desaparecidos que escondem um segredo de estado. A busca pelos quadros leva Baku e a Divisão de Mistérios a lugares inesperados, e os ajuda a desvendar um mistério do passado.

Fujimi pressiona Taro Atsumi, o sonhador, para que revele tudo sobre os quadros e a pessoa que os encomendou, Kensei Odaka. Baku começa a suspeitar de que nem tudo é preto no branco, e que Zero pode ter alguma motivação secreta por trás desta missão.

Baku precisa evitar a colisão de um meteoro com a Terra, e impedir a extinção da humanidade. Começa uma corrida contra o tempo para encontrar o sonhador e derrotar o Nightmare, mas Nox, munido de um equipamento misterioso, aparece para atrapalhar a missão.

As palavras e a nova transformação de Nox deixam Baku confuso, e ele passa a duvidar da sua capacidade como agente. Será que ele vai conseguir recuperar sua confiança a tempo, ou o meteoro vai colidir e extinguir a humanidade?

Enquanto Fujimi e Nasuka seguem à procura de Odaka, Baku recebe uma nova missão que traz consigo uma pergunta: ""Quem é o inimigo que deve ser eliminado?"". Quando a noite substitui o dia, chega a hora de descobrir qual é o pesadelo do qual um certo alguém não consegue acordar...

"Não existe noite sem amanhecer." O agente da CODE se liberta de seu pesadelo e vence o medo das trevas. As dúvidas sobre a agência se multiplicam. De quem é a voz misteriosa que faz a analogia das borboletas? Quem é, verdadeiramente, o vilão nesta história?

Em sua nova missão, Baku tem que encontrar Nem, que foi sequestrada por um Nightmare dentro do sonho de alguém que é fã dela. Enquanto tenta descobrir a identidade do sonhador, ele recebe o apoio de Minami, e tem que lidar com o desentendimento que teve com Zero.

Abalado com o sumiço de Zero, Baku continua investigando o paradeiro de Nem. Ao conversar com a sonhadora, ele descobre uma verdade perturbadora sobre o desaparecimento da celebridade no mundo real, e finalmente consegue pistas para encontrar o Nightmare.

Em sua nova missão, Baku se infiltra em uma escola e, para sua surpresa, lá encontra uma Nasuka adolescente e jogadora de basquete. Quando um Nightmare ataca, propondo um jogo mortal, cabe a Baku defender a detetive e seus colegas.

Ao descobrir a verdadeira identidade da sonhadora, Baku tem que lidar com revelações sobre seu próprio passado enquanto tenta salvar Nasuka e todos os outros alunos antes que o Nightmare os mate.

Baku, acompanhado por Nem, no papel de heroína, e duas crianças, parte em uma aventura de RPG num mundo de fantasia em sua nova missão. No entanto, o inimigo com que ele se depara não é o que parece.

Investigando a existência de múltiplos sonhadores, Baku descobre um elo entre as crianças afetadas. Ao voltar para o mundo dos sonhos, ele encontra a Porta da Alma, e testemunha o terrível desfecho do pesadelo. Agora cabe a ele e a Nem impedir que esse desfecho se concretize.

A nova missão de Baku é cruel: derrotar o Disaster Nightmare que deu as caras no mundo real e ainda tirar a vida de Odaka. Ele desconfia a CODE e questiona o sentido de lutar como agente. Enquanto isso, os Agentes Nº 5 e Nº 6 enfrentam o Disaster Nightmare e Kamen Rider Nox. Ao testemunhar o combate brutal de ambos, Baku percebe algo estranho acontecendo, e uma anomalia inesperada se manifesta!

Ao desfazer a transformação da forma ZEZTZ CATASTROM após a luta contra Nox, Baku cai em um sono profundo e acaba mergulhando no mundo do seu subconsciente. Lá, ele tem uma conversa profunda e sincera com Nem, descobrindo o sentimento que ela carregava dentro de si. Quando Baku finalmente desperta de tal sono, ele trata Minami e os outros com frieza... O que houve para que Baku passasse a agir assim?

Deixando de ser quem sempre foi e assumindo o manto de ""Agente Nº 7"", Baku já define sua próxima missão: ""Encontrar a Nem"". Enquanto ele desperta de seu sonho, A Madame já coloca o seu plano em ação. A situação pode piorar daqui para frente...

Baku desperta em uma cama de hospital e percebe que tudo o que ele viveu até então foi um sonho. O problema é que tanto as Capsems quanto o ZEZTZ Driver estão em posse dele, no mundo real. Confuso com a situação, ele volta a adormecer a fim de encontrar Nem e questionar o que houve. Seria tudo isso só um mero pesadelo ou algo mais

No mundo onírico, Baku conta a todos sobre tudo o que ele vivenciou em seu sonho premonitório. Segundo ele, uma sucessão de experiências aterrorizantes que o fez se preparar para ser um verdadeiro agente. Em segredo, Nox ouve todo o relato. Logo em seguida, Baku é atacado pela CODE e o confronto se inicia. O problema é que subitamente um novo e estranho fenômeno emerge... O que será que aconteceu?

Sob o ataque feroz de um Rider misterioso que surge repentinamente, Baku é arrancado à força de seu sonho e desperta. Com isso posto, Baku impõe a si mesmo a missão de desmascarar o inimigo. Em meio a isso, na CODE, Zero e o Agente Nº 3 enxergam uma ameaça crescente... Afinal, quem é ""Sieg""?