Hitomi Tsukishiro, uma garota de uma família de magos que perdeu a capacidade de ver as cores quando era jovem, é mandada para o passado quando era uma estudante do 2º ano no ensino médio. Hitomi se encontra no quarto de Yuito Aoi, uma aluna da escola Minamigaoka, e tenta fugir, mas a amiga de Yuito, Kurumi Kawai, a vê.

Hitomi vê a foto que Yuito desenhou e, por um momento, seu mundo recupera sua cor. Agora estando na casa de Kohaku, enquanto Kohaku está no exterior, Hitomi é convidado a se inscrever na Escola Minamigaoka pelos pais de Kohaku. Relutante, Hitomi conhece um lado inesperado de sua jovem avó. Então, para provar que ela é uma maga, Hitomi demonstra sua magia na frente dos outros alunos.

As “introduções de clube” para novos alunos já começaram. Incapaz de esquecer o desenho de Yuito, Hitomi visita o Clube de Artes da Fotografia. Escondendo sua incapacidade de ver cores, ela pega um pincel pela primeira vez em sua vida, a pedido de Yuito. Ela é amarrada em sua sessão de fotos. Solicitada por Kurumi, Hitomi ganha o papel de modelo, colocando-a em problemas impensáveis.

Kohaku voltou. Logo de cara, ela mostra mágica impressionante para a classe e se junta aos membros do Clube de Arte da Fotografia. Hitomi se sente intimidada por sua avó, que é o oposto dela. O clube decide apresentar uma combinação de fotos e desenhos para o festival cultural. Eles vão para a escola para fotografar a vista da cidade durante a noite, mas a atmosfera parece diferente do normal...

O agora aprovado Magic School Arts Club decide fazer uma festa de comemoração com seu novo membro, Kohaku. Hitomi é encarregada de tomar conta do Magic Shop, e quer aproveitar a chance para tentar encarar a magia novamente. Através da tentativa e do erro, ela cria sua primeira estrela de areia para dar a Yuito.

Quando Yuito usou a areia estelar que Hitomi o presenteou, ele viu o peixe dourado, o da imagem que ele desenhou na escola fundamental, que lhe trouxe seu primeiro prêmio. Por alguma razão, Hitomi é fascinada por ele. Aliás, o Clube de Artes de Fotografia Mágica está tendo uma sessão fotográfica no Glover Garden e o peixe dourado aparece de novo, fazendo Hitomi entrar no mundo de um desenho.

Yuito e a inevitavelmente embaraçada Hitomi entram de cara em suas férias de verão. O Clube de Artes de Fotografia Mágica começa os preparativos para seu tradicional campo de treino anual. Nesse meio-tempo, Kurumi se lamenta com os resultados nada favoráveis de seu exame simulado. Ela recebe conselho de sua irmã, Ichika, uma chef de massas, mas acaba mais preocupada.

O verão está quase no fim quando um dia, a caminho para casa, Kohaku é levada ao lugar onde Hitomi viu cores. Kohaku, que deseja muito deixar as pessoas felizes através da mágica, luta para determinar a razão por que o mundo de Hitomi perdeu suas cores. Com a ajuda de Yuito, os três tentam recriar as condições presentes no ‘dia em que ela viu cores’.

Hitomi pede conselhos ao presidente Sho com esperanças de melhorar suas habilidades fotográficas. Os dois prometem fazer uma sessão de fotos juntos no próximo dia de folga deles. O dia chega e, com as câmeras na mão, os dois vão caminhando para os lugares. Após o dia inteiro juntos, cada um segue seu caminho, mas Sho chama Hitomi.

Hitomi quer fazer as pazes com Asagi e vai conversar. Asagi fala o que sente e, depois de ficarem sabendo sobre os sentimentos um do outro, o clima entre eles melhora. Enquanto isso, o Magic Photography Arts Club se prepara para o Festival da Cultura. Kohaku sugere que o Clube Mágico execute uma "foto de magia de entrada" no festival. O grupo apresenta um desenho e Yuito tem um encontro.

O Magic Photography Arts Club está ocupado preparando o Festival da Cultura. Kurumi, Sho e Asagi estão trabalhando em sua exibição. O desenho de Yuito para o evento do Magic Club está progredindo, e Kohaku e Hitomi estão focados na prática de mágica. Então, de repente, Hitomi desaparece na câmara escura. Ela é encontrada logo, mas Kohaku percebe o perigo. Hitomi caiu em uma fenda do tempo.

Dois dias para a lua nova e para a partida de Hitomi. A inquietação e a solidão por ter que partir perduram enquanto a cortina se abre. O Magical Art Illusion do clube ganha fama, enquanto Asagi se delicia com o prazer que suas fotos trazem, e Yuito descobre a alegria em desenhar para os outros. No segundo dia do festival, Hitomi e Yuito visitam a escola para aproveitar o tempo que resta.

Finalmente chegou a hora da despedida. Depois do festival, Hitomi, Kohaku e todos os membros do clube se reúnem em um parque próximo. Um por um, eles compartilham os sentimentos mais profundos com Hitomi, à medida que ela se prepara para sua jornada. Enquanto ela expressa sua gratidão, uma anomalia acontece na ampulheta. Yuito tenta resgatar Hitomi, e os dois desaparecem, de repente.